从外形结构上看，两者区别甚大，从设计角度来对比，二维混合机可设计容积比较大，三维混合机设计容积小，后者更适合实验室使用，而且后者可设计成可换桶式，方便更换混合容器，清理方便，建设交叉感染，更容易满足新版GMP标准。
二维混合机是在X轴和Y轴两个方向运动，而三维混合机是在XYZ三个轴运动。三维混合机效率和混合度远高于二维混合机。二维混合机广泛应用于医药，化工，食品，饲料，农药等行业，尤其适用于大吨位各种固相物料的混合。而三维装料的筒体是在主动轴的带动下，作周而复始的平移转动和翻滚等复合运动，促使物料沿着筒体作环向、径向和轴向的三向复合运动，从而实现多种物料的相互流动、扩散、积聚、掺杂，达到均匀混合的目的，此机主要用于制药、化工、食品、轻工、电子、机械、矿冶、国防工业以及各科研单位的粉状、颗料状物料的高均匀度混合。
二维混合机的混合筒在转动的同时又参与摆动，使筒中物料得以充分混合，使该机具有混合迅速，混合量大，出料便捷等特点。三维混合机装料率大，最高可达80%（普通混合机仅为40%），效率高，混合时间短。且筒体各处为圆弧过渡，并经过精密抛光处理，达到GMP要求，是目前混合机中的一种理想产品。
两者的加料方式均可人工投料或者采用真空上料机和螺旋投料斗上料，这一点有共性。一般而言，两者的材质均为SUS304不锈钢，特殊要求可使用SS316L不锈钢。
